在药物炼制方面，正子时与活子时也各有侧重。正子时主要采集天地间的，即宇宙自然能量；活子时则主要调动体内的，即精气血三宝。元代陈致虚在《金丹大要》中论述：外药生于正子时，内药产于活子时，二者相合，方成金丹。这种内外药物的区分，反映了内丹学天人合一的基本理念。
从修炼效果来看，正子时的修炼更注重筑基培元，通过长期在正子时修炼，可以逐步改善体质，延长寿命。而活子时的运用则直接关系到通关展窍的实效，是小周天能否打通的关键。明代尹真人在《性命圭旨》中比喻道：正子时如农夫之耕耘，活子时如果实之成熟，二者缺一不可。
正子时与活子时的区分并非绝对。随着修炼层次的提高，二者会出现融合统一的趋势。高级阶段的修炼者可以达到时时皆子时的境界，即无论何时修炼，都能保持子时的能量状态。这种境界在《周易参同契》中被描述为与天地合其德，与日月合其明的至高状态。
正子时可能与人体的昼夜节律（生物钟）密切相关。研究表明，夜半时分人体褪黑激素分泌达到高峰，各种修复机制最为活跃。而活子时现象则可能与自主神经系统的特殊激活状态有关。
在内丹传承历史上，不同流派对正子时与活子时的重视程度各有偏重。北宗全真教更强调正子时的规律修炼，主张百日筑基的严格作息；而南宗则更注重活子时的随机应变，提倡顿悟渐修的灵活方法。
对于现代修炼者而言，理解正子时与活子时的区别与联系，掌握相应的炉鼎运用方法，是安全有效修炼的重要前提。无论是遵循天时的正子时修炼，还是把握身机的活子时运用，都需要在明师指导下循序渐进，避免盲目冒进可能带来的偏差。只有将天时地利与人身小宇宙完美结合，才能真正领会内丹修炼盗天地、夺造化的玄妙境界。